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解锁癌症奥秘:棕榈酸重编程促进结直肠癌进展

发布时间:2024-08-26

癌症的代谢重编程一直是研究的焦点,然而,代谢如何影响癌症进展尚不清楚。棕榈酸是一种十六碳的饱和脂肪酸,作为脂肪的一个主要组成部分,棕榈酸可为机体提供能量,另一方面,棕榈酸可以参与肿瘤细胞信号传导途径,或者作为蛋白棕榈酰化的底物,影响多个细胞信号分子的功能。2023年3月7日,中山大学医学院附属第六医院兰平教授团队在Cell Discovery上在线发表了题为“Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression”的文章,该研究发现代谢酶酰基辅酶 A 氧化酶 1 (ACOX1) 通过调节棕榈酸 (PA) 重编程来抑制结直肠癌 (CRC) 进展。ACOX1是一种肿瘤抑制因子,其下调会增加PA介导的β-catenin棕榈酰化和稳定性,并过度激活β-catenin信号传导,从而促进CRC进展。这一发现揭示了一个全新的治疗途径,即通过靶向β-catenin棕榈酰化,为未来的癌症治疗提供了宝贵的线索。

日文副标题:Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression(Cell Discovery,IF=38.09,2023)

中文字幕微信标题:ACOX1去磷酸化诱导的棕榈酸重编程促进β-catenin棕榈酰化,从而驱动结直肠癌进展

样板类形:临床癌和癌旁组织、HEK293T细胞

涉及到组学方法:定量蛋白组、S-棕榈酰化修饰组

一、一般研究分析数据

1.ACOX1 再降并与 CRC 突破重要性

只为确定好在结人体直肠肉瘤再次发生中起着核心意义的基础新陈分解对应什么是DNA,作家对源于不一信息集的少于1000个CRC中2754个基础新陈分解对应什么是DNA的转录技术做好了介绍,涵盖肝癌什么是DNA组图谱(TCGA) CRC RNA-SeqV2、TCGA CRC RNA -Seq和什么是DNA理解标准化(GEO)。虽然,还对源于诊疗实践蛋清质组肉瘤介绍同盟 (CPTAC) 信息集和本定量研究中的诊疗实践范例化学发光法质谱 (MS) 的少于100个CRC中的等基础新陈分解对应什么是DNA的蛋清质技术做好了介绍。借助叠加介绍确定了 CRC中各种相关更改的 11 个基础新陈分解对应什么是DNA(图 1)。具体情况看来,ACOX1是真正的基础新陈分解限速酶,被评定于之后介绍(图1)。

图1 ACOX1下跌并与CRC新况相关内容(图源:Zhang et al., Cell Discovery, 2023)

2. ACOX1缺损可不断增强 β-catenin并借助PA不断增强其转录活力性

为了能让探讨ACOX1调高的CRC相应淋巴肿瘤体人体细胞系手机网络信号传输,在TCGA数据信息文件冷库文件采取了表观遗传集聚集定性分析 (GSEA)。GSEA 表示ACOX1与Wnt手机网络信号传输负相应。与此时,公众数据信息文件冷库文件ACOX1品质较低的淋巴肿瘤阻止和转至样板中β-catenin靶表观遗传调整,这在淋巴肿瘤体人体细胞系实验设计操作中能够 进一次证明。不仅如此,在淋巴肿瘤体人体细胞系魅力论文检测实验设计操作中挖掘,ACOX1的无限表现可抑制了CRC淋巴肿瘤体人体细胞系的魅力,而β-catenin的无限表现还可以追回在这种具体情况,进一次研发挖掘ACOX1变动可借助PA安全稳定 β-catenin球蛋白,以此强化其转录抗逆性(图2)。

图2 ACOX1的缺少可稳定可靠β-catenin并实现PA激发转录亲水性(图源:Zhang et al., Cell Dis

3. PA介导的β-catenin棕榈酰化遏制β-catenin的泛素化生物降解

事先的分析是因为,PA是蛋清质棕榈酰化的底物,另外蛋清质棕榈酰化就可以改善蛋清质-蛋清质间接角色。本分析中,内源性β-catenin的棕榈酰化在HEK293T人体细胞中有得知。PA 和棕榈酰化可抑中药制剂2-溴棕榈酸酯 (2-BP)分辨曾加和可缓和了β-catenin在466位半胱氨酸的棕榈酰化装饰语。2-BP棕榈酰化的可缓和也减少了β-catenin的丰度,并驱动β-catenin多泛素化(图3)。这样的信息是因为,β-catenin蛋清的安全稳定量分析就可以经由新技术棕榈酰化装饰语来的调节。

图3 PA介导的β-catenin棕榈酰化可可以抑制β-catenin的泛素化(图源:Zhang et al., Cell

4. 地球结结肠癌中的DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴功能紊乱

考虑到能让知道CRC中DUSP14、ACOX1 和β-catenin中间的有关的性,我对物种进化淀粉酶质图谱(HPA)统计资料聚焦的相配客户模本量完成了临床上模本量的免疫细胞集体普通机械,并检验了 ACOX1 和 DUSP14 中间的负有关的性或 ACOX1 和 β-catenin中间的负有关的性。我表明 DUSP14-ACOX1-β-catenin 轴在早 CRC 中絮乱。考虑到能让更强地检验此种关注毕竟,抽取了24个早 CRC 模本量 (T) 或挨近的正确乙状结肠集体 (N)。等等CRC模本量中 ACOX1 淀粉酶偏态可以减少,而 DUSP14 和 β-catenin 偏态上升(图 4)。还有,DUSP14与ACOX1、ACOX1与β-catenin中间的负有关的性或β-catenin与DUSP14中间的正有关的性也在CRC模本量中到进一大步表明(图4)。上面所写,DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴在CRC现况中起着至关最重要的功能,但会 Nu-7441能按照仰制 DUSP14-ACOX1-PA成為诊治CRC 的不确定方法。

图4 全人类CRC中DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴的功能紊乱(图源:Zhang et al., Cell

二、工作小结

代谢转化物行也可以调整核膳食纤维的当地翻译后装饰,如PA行装饰核膳食纤维棕榈酰化,也可以调整核膳食纤维作用。本探析挖掘一堆种新的β-catenin核球核核蛋白酶装饰——棕榈酰化,同时棕榈酰化也可以调整β-catenin安稳性的长效机制,这补点了自己对精品β-catenin核球核核蛋白酶预警传输的询问。

三、拜谱个人心得体会

棕榈酸 (PA) 是一种ACOX1底物和高脂肪饮食中的主要脂肪酸,已被证明可以产生能量并调节参与癌症发展的细胞内信号分子。PA 可以在棕榈酰化过程中修饰半胱氨酸残基。越来越多的证据表明,蛋白质(如 PDL1、GULT1、STAT3 和 IFNGR1)的棕榈酰化会影响蛋白质功能和肿瘤进展。拜谱生物作为一家国内领先的多组学公司,在棕榈酰化修饰积累了丰富的项目经验,并已完成半胱氨酸修饰蛋白质组学产品的全面升级,助力Nature文章发表,现可提供棕榈酰化、亚硝基化、谷胱甘肽化、次磺碱化、硫巯基化、Total 钝化恢复原、氧化钙含量巯基蛋白质组学拜谱生物,欢迎大家咨询!

规范文献资料:

Zhang Q, Yang X, Wu J, Ye S, Gong J, Cheng WM, Luo Z, Yu J, Liu Y, Zeng W, Liu C, Xiong Z, Chen Y, He Z, Lan P. Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression. Cell Discov. 2023; 9(1):26. doi: 10.1038/s41421-022-00515-x.
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